第二代高通量测序都有哪些平台

中心建立了集基因组学，生物信息学和蛋白质组学于一体的，具有国际一流水平的技术平台，包括全国范围的遗传资源样品收集网络，大规模测序平台，全基因组扫描分型，疾病基因精细定位克隆，高通量SNP检测，大规模全长新基因的克隆，DNA芯片，大规模蛋白质组分析，拥有Roche 454测序仪一台，ABI 3730测序仪3台测序仪，MEGABACE 4000测序仪2台，MEGABACE1000型测序仪6台, 每日可完成四十万条DNA序列测定和二万个基因分型;SUN E3500, E450服务器、集群计算机、Oracle数据库以及各种应用软件为中心提供了强大的数据计算分析和管理维护能力。

Illumina公司的Solexa测序平台，目前主流的型号的HiSeq-2500，以及Hiseq-2000，数据通量在每张Flow cell 300G数据，每次最多可以上2张Flow cell，单张Flow cell运行时间大约在11天左右。读长通常是100BP，据说近期有了长度上的突破。还有一个型号是MiSeq，该机器运行通量较小，但是读长大约在150BP以上，常用于微生物检测，而且该型号获得FDA认证，可以进行临床样本的检测。Solexa的错误类型主要是颠换。

罗氏454平台，主要特点是测序长度很长，目前大于1K的测序没有什么难度了，比较适合基因组测序，用于搭建基因组框架，也常用于微生物基因组测序。该平台主要的错误类型是插入缺失。

ABI的SoLID平台，听说该平台不在维护了，故而不再描述。

Life的Ion torrent平台，目前主要有2种型号，较早的一个型号是PGM，该测序仪原理类似于454测序，与454不同的是，454是化学反应发光进行检测，而PGM是半导体测序，检测H离子，如果发生了碱基互补配对，那么高能磷酸键就会释放H离子，导致电位变化，从而根据已知加入的碱基，就可以判断待测序列是否与已知加入的碱基发生互补，从而达到测序目的，测序长度可以达到400BP，主要用于微生物的检测，错误类型也是插入缺失错误。最新的型号是IonProton，该机器与PGM测序原理一致，但是测序通量由PGM的1G数据上升至10G数据，测序精度也较PGM有大幅度提升，测序时间大约是1天。

PacBio的单分子三代测序，该测序仪最大的特点就是测序长度比454更长，更加有利于基因组的拼接工作，有些较小的微生物可以直接将基因组测通成环状。

以下是一些在基因数据库领域有所涉足的上市公司，仅供参考：

1. Illumina(ILMN)：全球领先的基因测序公司，提供各种基因测序仪器和相关服务。

2. Thermo Fisher Scientific(TMO)：全球领先的科学仪器和试剂供应商，提供生命科学研究和临床诊断等领域的各种产品和服务。

3. Qiagen(QGEN)：生命科学和诊断领域的领先供应商，提供基因测序、RNA分析、蛋白质组学等方面的产品和服务。

4. BGI Genomics(300676.SZ)：全球领先的基因测序和基因组学公司，提供各种基因测序和分析服务。

5. Pacific Biosciences(PACB)：基因测序技术公司，提供单分子实时(SMRT)测序技术和相关服务。

6. Oxford Nanopore Technologies(私人公司)：提供基于纳米孔技术的基因测序仪器和服务，其MinION和PromethION测序仪已经广泛应用于科研领域。起点排行榜

7. Myriad Genetics(MYGN)：提供遗传疾病和癌症等方面的诊断测试和相关服务。

8. Natera(NTRA)：提供产前和肿瘤等领域的基因检测和相关服务。

这些公司在基因数据库领域具有不同的专业性和领域覆盖面，它们的产品和服务有助于推动基因组学和生物技术的发展。